Совет
Состоит из уполномоченных представителей всех стран. Стабильно раз в год Совет собирается для обсуждения насущных вопросов и дальнейшего пути развития Сообщества Героев. При этом стоит учитывать, что присутствие представителей стран на ежегодном собрании является добровольным, но в случае отказа какого-либо государства принимать участие в текущем собрании, оно лишается права голоса до следующего созыва Совета.
Совет - единственные, кто может объявить об официальном роспуске Сообщества, но только при наличии неоспоримых фактов, подтверждающих необходимость подобной меры, а также если за инициативу роспуска проголосует более 85% всех присутствующих на собрании уполномоченных представителей стран. До сих пор голосование о роспуске Сообщества ещё ни разу не инициировалось.

Руководящий состав
Люди, отвечающие за выполнение распоряжений Совета, а также обеспечивающие решение текущих проблем и вопросов. Члены руководящего состава высшего звена в конце каждого года обязаны подготовить подробный отчёт о проделанной работе для последующего представления его Совету.

Центр управления бедствиями (ЦУБ)
Принимают и обрабатывают сообщения о любых аномалиях, включая активность монстров или членов Мантикоры, в соотвестветствии с которыми координируют действия супергероев. По имеющимся у них данным присваивают возникшей опасности соответствующий уровень угрозы и, в случае необходимости, также отдают приказ о начале эвакуации из зоны поражения.

Научные сотрудники
Отвечают за исследовательскую деятельность Сообщества Героев. Как правило, связана эта деятельность с изучением Икс-гена и монстров, разработкой новейшего оружия, кибер-имплантов и их установку.

Полевые специалисты
Люди, которые по наводкам ЦУБ обязаны прибыть на место возникновения какой-либо аномалии для её изучения. Как правило, большинство подобных аномалий связаны с первым проявлением сверхспособностей у мета-людей, и чаще всего полевые специалисты имеют дело с перепуганными детьми и подростками, а также с их обеспокоенными родителями. Именно поэтому среди них больше всего ценятся специалисты в области психологии, а также мета-люди с навыками телепатов и эмпатов.
В случаях, когда природа аномалии не подтверждена и существует вероятность возникновения угрозы высокого уровня, группу полевых специалистов обязан сопровождать минимум один супергерой соответствующего предполагаемой угрозе ранга.

Оценочная комиссия
Специалисты, ответственные за присвоение супергероям определенного ранга, а также принимающие заявки на вступление в Сообщество Героев от людей, не обучавшихся в Академии. Проводят все необходимые в этих случаях собеседования и экзамены, по результатам которых выносят окончательное решение.

Академия Супергероев
Ответственны за разработку программ подготовки будущих супергероев и их непосредственную реализацию. Главное здание Академии располагается неподалёку от штаба Сообщества в Берлине, также имеет филиалы в шести крупных городах мира: Москва, Лондон, Вашингтон, Каир, Сидней и Токио. В преподавательский состав, как правило, входят действующие супергерои Сообщества Героев от A-ранга и выше.
Люди, завершившие обучение в академии, автоматически становятся членами Сообщества в роли супергероев В-ранга.

Супергерои
Основа всей организации, её боевая мощь и главная забота. Как правило, действуют на своё усмотрение в соответствии с развитием той или иной ситуации, но обязаны выполнять все поступающие от ЦУБ распоряжения.
Зона их деятельности чаще всего ограничена населенным пунктом, в котором они на данный момент находятся, но ЦУБ может принять решение о временной передислокации супергероев для устранения угрозы высокого уровня.
Получают ежемесячное пособие в зависимости от ранга, плюс премию, размер которой зависит от количества совершенных подвигов. Для получения премии каждый подвиг должен сопровождаться письменным отчетом.

Структура Мантикоры, несмотря на её реорганизацию, всё ещё представлена в довольно хаотичном виде. Но так или иначе все её члены беспрекословно подчиняются воле Теневого Властелина, которую распространяют его ближайшие советники. Все несогласные, бунтовщики и просто неугодные Властелину люди так или иначе исчезают, целиком или частями отправляясь на стол учёных Мантикоры, чьи исследования, в отличие от Сообщества Героев, особой гуманностью не отличаются.
За координацию действий суперзлодеев и их информирование отвечает группа хакеров, Легион, которые без особых проблем перехватывают основные сообщения ЦУБ. Состав Легиона и его мотивы не известны даже Теневому Властелину, но он с удовольствием пользуется его услугами, пока тот готов их предоставлять.
Для общения между собой члены мантикоры используют разработанное Легионом приложение, «ISERVE», которое представляет собой интернет-площадку для размещения различных объявлений: продажа оружия (наркотиков, запрещенных препаратов, сырья и т.д), предоставление услуг, работы и прочего. Доступ к нему имеется лишь у действующих членов Мантикоры и приближённых к ним лиц.

Чётко выраженная структура в Лиге отсутствует. Любой "хранитель" вправе инициировать собрание, оповестив своих собратьев, для обсуждения серьёзных текущих вопросов, решение которых будет принято путём голосования.
Для быстрого обмена информации между собой, как правило, используют различные площадки в интернет-пространстве, работоспособность которых поддерживается группой одарённых программистов. Хакеры Лиги всё ещё не могут сравниться с Легионом Мантикоры, но их профессионализм всё же бросает вызов лучшим компьютерным гениям преступного мира.
Подобно Легиону, нередко "одалживают" важную информацию у ЦУБ, но у них этот процесс, - как и процесс последующей передачи информации остальным членам Лиги, - занимает несколько больше времени, а потому хранители всё равно отстают от Сообщества Героев и Мантикоры на несколько шагов.